تواجه جزيرة سقطرى تهديدات متكررة تُنذر بتدهور بيئتها الطبيعية، إذ تتفاقم التحديات بفعل المخالفات البشرية، والذي جعلها مهددة بوضعها على قائمة التراث المعرض للخطر، من قبل لجنة التراث العالمي التابعة لمنظمة العلوم والثقافة (اليونسكو)، إلى جانب ذلك تواجه الجزيرة آثار التغيرات المناخية.
